Trascorsi i tempi del paganesimo, quando il cristianesimo cessò di essere perseguitato e fu riconosciuto come religione mondiale, sembrerebbe che tutte le differenze dovessero essere risolte. Ma a volte solo i Concili ecumenici potevano risolvere i conflitti emergenti, confutare gli insegnamenti eretici - non c'era pace nemmeno all'interno della Chiesa.
Il primo Concilio Ecumenico fu il Concilio di Nicea, convocato nel 325. La ragione di ciò era l'insegnamento diffuso del presbitero alessandrino Ario. La sua essenza era negare l'identità tra Dio Padre e Dio Figlio. Ha sostenuto che Gesù Cristo è stato creato dal Signore, ma non è la sua incarnazione. Tale idea confutava fondamentalmente tutti i dogmi del cristianesimo, e quindi inizialmente l'insegnamento di Ario fu respinto dal Consiglio locale. Tuttavia, l'orgoglioso presbitero rifiutò di riconoscere la decisione del Consiglio come legittima e continuò a conquistare i fedeli.
Poi l'imperatore Costantino invitò vescovi di tutto il mondo al Concilio Ecumenico nella piccola città di Nicea (oggi chiamata Iznik e situata nel territorio della moderna Turchia). Alcuni dei rappresentanti della Chiesa presenti portavano tracce di tortura sui loro corpi,ricevuto in nome del vero cristianesimo. Erano presenti anche i vescovi che sostenevano Ario.
Il dibattito è durato più di due mesi. Durante questo periodo ci furono molte discussioni, discorsi di filosofi, chiarimenti di formulazioni teologiche. Come narra la leggenda, la manifestazione di un miracolo divino pose fine ai litigi. Come unità di tre principi, ha dato un esempio di un frammento di argilla: acqua, fuoco, argilla danno un tutto unico. Allo stesso modo, la Santissima Trinità è essenzialmente un Dio. Dopo il suo discorso, dal frammento apparve il fuoco, apparve l'acqua e si formò l'argilla. Dopo un tale miracolo, il Concilio Niceno alla fine respinse il falso insegnamento di Ario, lo scomunicò dalla Chiesa, approvò il Credo e stabilì 20 regole di disciplina ecclesiastica, stabilì la data per la celebrazione della Pasqua.
Ma questo Consiglio di Chiesa non ha posto fine a questo problema. La polemica è andata avanti per molto tempo. Anche ora si sentono ancora i loro echi: l'arianesimo ha costituito la base degli insegnamenti dei Testimoni di Geova.
Oltre al Concilio del 325, vi fu anche il Secondo Concilio di Nicea, convocato dall'imperatrice Irene di Costantinopoli nel 787. Il suo scopo era quello di abolire l'iconoclastia che esisteva in quel momento. In effetti, l'imperatrice fece due tentativi per convocare un Concilio ecumenico. Ma nel 786, le guardie che sostenevano gli iconoclasti irruppero nel Tempio dei Santi Apostoli a Costantinopoli, dove iniziò il lavoro del Concilio. I santi padri dovettero disperdersi.
Dopo aver fatto ricorso a notevoli trucchi, sciogliendo la vecchia guardia, reclutando nuove truppe, Irina convocò comunque la Cattedrale a787, ma lo trasferì da Costantinopoli a Nicea. Il suo lavoro è durato un mese, in seguito ai suoi risultati, è stata ripristinata la venerazione delle icone, sono state consentite nelle chiese.
Tuttavia, anche questo Concilio di Nicea non è riuscito a raggiungere pienamente il suo obiettivo. L'iconoclastia ha continuato ad esistere. Il movimento iconoclasta fu definitivamente sconfitto solo nell'843, al Concilio di Costantinopoli.